רבותינו נשיאינו גילו, כי הבעל שם טוב הסתלק ביומו הראשון של חג השבועות. יום קבורתו, לעומת זאת, לא נודע. הרבי התייחס לכך באחת משיחותיו הקדושות, אך לא הביע מסקנה ברורה.
הרה"ח ר' אברהם מאיור ע"ה סיפר בעניין זה:
"בסעודת חג השבועות אצל הרבי הרש"ב, דובר אודות הסתלקותו של הבעל שם טוב. הרבי אמר, כי הבעל שם טוב הסתלק ביומו הראשון של החג, ודוד המלך הסתלק ביומו השני.
"אביו של כ"ק אדמו"ר נשיא דורנו, הרה"ק המקובל רבי לוי יצחק, הביע תמיהה: "הלוא לפי הדין, מתעסקים נוכרים עם גופו של מי שנפטר ביום טוב ראשון, והכיצד ייתכן, שהתעסקו עם גופו הקדוש של הבעל שם טוב נוכרים?!" השיב הרבי: "הוא קבר את עצמו".